Mikroorganizmi se mogu definirati kao vrsta živih bića male veličine do te mjere da su nevidljivi ljudskom oku. To mogu biti različite vrste, među najvažnijima su alge, gljive, bakterije itd. Postoje oni koji održavaju hipotezu da su neki mikroorganizmi bili preteča života na planeti Zemlji, dok druge nešto složenije pretpostavke potvrđuju da su oni izvanzemaljskog podrijetla i da su se u to vrijeme proširili po licu planete i dali život svemu što je danas. Općenito, vrlo je često da se mikroorganizmi sastoje od stanice jedinstven, međutim to ne znači da nema onih koji se sastoje od više stanica.
Potaknuti potrebom suočavanja s bolestima, proučavanje mikroorganizama imalo je velik impuls, iz tog razloga kao što je i medicina evoluirala na isti način kao i znanje o tim živim bićima.
Određeni mikroorganizmi smatraju se odgovornima za štetu pojedine hrane, koja može biti štetna za one pojedince koji su konzumirali takvu hranu, uzrokujući razne bolesti, unatoč tome što postoje određeni mikroorganizmi koji mogu pridonijeti različitim postupcima, primjer za to je fermentacija gdje se navedeni organizmi koriste za proizvodnju hrane poput jogurta ili sira, odnosno postoje mikroorganizmi koji mogu promijeniti konfiguraciju određene hrane ili čak produljiti njihov životni vijek.
Mikroorganizmi koji imaju najveću prisutnost u prirodi su bakterije koje se mogu naći na različitim vrstama staništa, postoje bakterije koje mogu biti štetne po ljudsko zdravlje, primjer za to je " Escherichia coli ", koja je odgovorna za bolesti poput septikemije. Unatoč tome, postoje i druge bakterije koje mogu biti korisne za tijelo, primjer je "Lactobacillus acidophilus" koji ima sposobnost stvaranja različitih tvari kao što su vitamin K i vodikov peroksid koji mogu biti od velike pomoći za organizam.
