Aerobni mikroorganizam opisan je kao vrsta organizma koji ima strogu potrebu za konzumacijom dvoatomskog kisika da bi mogao živjeti, klasificiran je kao fakultativni aerobni organizam kada može živjeti ili ne uz prisutnost kisika.
Pridjev aerobni ne samo primjenjuje se klasificirati organizam, to se također može koristiti za opisivanje okruženje ili metaboličke reakcije, označili je ime „aerobnog okoliša” i „aerobnog metabolizma” , odnosno, u oba slučaja kisik se Prisutan je u obilnim količinama, (označavajući ga kao mikroaerofilno okruženje kada kisika ima u malim količinama, ali ga uopće nema), kao primjer aerobnog metabolizma može se navesti fotosintezaKisik koji okolišu doprinosi velikim količinama kisika, čiji kisik koriste eukariotske stanice zahvaljujući prisutnosti mitohondrija zaduženih za provođenje staničnog procesa disanja.
Ovaj se izraz uglavnom koristi u klasifikaciji patogenih mikroorganizama kao što su bakterije, aeobne bakterije, kako njihovo prezime ukazuje, imaju potrebu naseljavati sredine bogate dvoatomskim kisikom kako bi mogle pravodobno rasti, razmnožavati se i razlikovati se, odnosno one su vrsta bakterija koji provode stanično disanje, prema potrebi za kisikom, možemo ih svrstati u nekoliko skupina: stroge aerobne bakterije (obvezni aerobi) trebaju kisik za provođenje svojih metaboličkih procesa, fakultativne anaerobne bakterije mogu koristiti kisik, a zauzvrat mogu raditi i bez njega, mikroaerofilne bakterijekoriste kisik u niskim koncentracijama, aerotolerantne bakterije mogu živjeti u prisutnosti kisika, ali ga ne koriste metabolički.
