Bakterije su jedan od najzanimljivijih mikroorganizama unutar svih onih koji su proučavani iz mikrobiologije. Istrage kojima su ova mikroskopska i jednostanična bića glavna lica, općenito imaju izravan utjecaj na različita područja od interesa za znanost i sve vrste ljudskih aktivnosti, od medicine do poljoprivrede.
Ako uzmemo u obzir prehranu prokariota, pronalazimo sve mogućnosti prisutne u živim bićima. Nije iznenađujuće što su bakterije prvi organizmi prisutni na Zemlji i u milijardama godina koje su evoluirali, prilagodili su se svim mogućim načinima i oblicima prehrane.
Heterotrofi, većina prokariontskih stanica su heterotrofne. Odnosno, hranu dobivaju ugrađivanjem organske tvari koju tvore druga živa bića. Među njima je najviše saprofita, što znači da se hrane mrtvom organskom tvari i na taj način doprinose recikliranju materije u ekosustavima.
Mogu provoditi aerobne katabolizme - uz upotrebu kisika i anaerobne, fermentacijom, od kojih su mnoge korisne za našu industriju.
Postoje heterotrofne bakterije koje žive povezane s drugim organizmima, na obostranu korist, pa bi bile simbiotske. Jasan primjer je Escherichia coli, bakterija koja živi u ljudskom crijevnom traktu. Mnogi biljojedi mogu iskoristiti celulozu zahvaljujući mikrobnoj flori u svojim probavnim traktima koji sadrže enzim celulazu. Sljedeća je simbioza nekih biljaka s bakterijama koje fiksiraju atmosferski dušik (Rhizobium) u kojem biljka iskorištava dio dušika fiksiran od strane bakterija, što pak iskorištava dio biljnog šećera.
Mnogi drugi su paraziti, oni iskorištavaju organske tvari tog drugog živog bića uzrokujući im gubitak; To je slučaj sa svim patogenim bakterijama koje uzrokuju bolest. Neki su patogeni (klamidija, rahitis i neke mikoplazme) pojednostavili svoju strukturu i mogu se razmnožavati samo unutar druge stanice: oni su obvezni paraziti.
Unutar egzotične skupine miksobakterija, vrste skliskih bakterija koje imaju sposobnost agregacije nekoliko stanica da bi stvorile strukture koje im omogućuju migraciju, uključuju neke koji su grabežljivci drugih bakterija.
Bakterije se hrane tim resursima i, kao što smo primijetili, njihove strategije preživljavanja vrlo su raznolike. Bez sumnje, svi su oni primjer evolucijske prilagodbe kroz povijest i tako su i danas, imaju temeljnu ulogu u prirodi i životnim ciklusima našeg planeta.
